蕉果被运到加工场后，最好将果穗倒置，果指向下靠着堆放。墙上应有海绵或薄膜护边，减少机械伤。切忌果穗打横堆放，互相压伤。然后用特制的月牙形落梳刀进行落梳，注意切口要整齐。分梳后的蕉果放入水中洗涤灰尘及果指尾部的干蕉花及乳汁，用时挑出不合格的果指和烂果，并进行分级。内销北运果可浸入防腐剂30秒，切口处要重点浸泡。浸完后晾干包装。大型加工场有时用电动旋转轮盘，配备大马力风扇以加快工作效率。
常用的防腐剂有45％特克多1000倍液，25%扑海因250倍液。广东省农科院植保所以施保功为主要药剂配制出的40%鲜宝香蕉保鲜剂300倍液，效果也很好。 在小规模采收优质香蕉时也可以采用就地加工，采下的果穗即分梳，装箱，减少采后运输及加工场多环节操作造成机械伤。
