多年来的工作实践，针对畜禽养殖场流行病学的特点，以达到消灭传染源、切断传播途径为目的。为提高动物的抵抗能力，特制定以下消毒程序及消毒药的使用方法以供参考。
1 消毒前做好机械性清除
要使消毒药物作用充分发挥，必须使药物接触到病原微生物。如被消毒的现场存在大量粪便、饲料残渣、畜禽分泌物、体表脱落物等有机物，以及鼠粪、污水或其它污物，会使消毒药无法接触被掩盖的病原而丧失消毒作用。同时，消毒药物与有机物，尤其是与蛋白质有不同程度的亲和力，可结合成为不溶性的化合物，阻碍消毒药物作用的发挥。消毒药物被大量的有机物的消耗，严重降低了对病原微生物的作用浓度。所以说彻底的机械清除前应先将可拆卸的用具如食槽、水槽、笼具、护子箱等拆下，运至舍外清扫、浸泡、冲洗、刷刮，并反复消毒。舍内在拆除用具设备之后，从屋顶、墙壁、门窗，直到地面和粪便池、水沟等按顺序认真打扫清除，然后用高压水冲洗直至完全干净。最好先用消毒药物喷雾和喷洒，以免病原微生物四处飞扬和顺水流排出，扩散至相邻的畜禽舍及环境中，造成扩散污染。
2 严格按程序进行消毒
消毒应按一定程序进行，不可杂乱无章随心所欲。一般可按下列程序进行，舍内从上到下（屋顶、墙壁、门窗、地面）喷洒大量消毒液搬出和拆卸用具和设备-从上到下清扫清除粪尿等污物-高压水充分冲洗-干燥-从上到下用消毒药液喷雾，雾粒应细，部分雾粒可在空中停留15分钟左右，换另一种消毒药品喷雾-密闭门窗后用甲醛熏蒸一次一封闭空舍7～15天，特别强调的是，彻底消毒必须保证畜禽全进全出。
3 饮水消毒
许多消毒药物，按其说明书，可用于畜禽的饮水消毒，并称"高效、广谱、对人畜无害"，可100%杀灭某细菌、某病毒，用于饮水或拌料内服，在1～3天可扑灭某某病等，这显然是夸大其词。饮水消毒实际是对饮水的消毒，畜禽喝的是经过消毒的水，而不是喝的消毒药水，饮水消毒实际是把饮水中的微生物杀灭或控制畜禽体内的病原微生物。如果任意加大水中消毒药物的浓度或长期饮用，除可引起急性中毒外，还可杀死或抑制肠道内的正常菌群，对畜禽健康造成危害。在临床上常用的饮水消毒剂有氯制剂、季胺盐类、碘制剂及高锰酸钾等，在使用时要严格按说明书中所确定的浓度配制。出现中毒原因往往是浓度过高或使用时间过长。
4 畜禽带体消毒
畜禽带体消毒不应限于畜禽的体表，而应包括整个畜禽所在空间和环境。有许多病原微生物是通过空气传播的，所以将畜禽带体消毒视为全方位消毒可能更为全面。消毒时应将喷雾器喷头高举空中，喷嘴向上喷出雾粒，雾粒可在空中缓缓下降，除与空气中的病原微生物接触外，还可与空气中尘埃结合，起到杀菌、除尘、净化空气、减少臭味的作用，在夏季还有降温的作用。做喷雾消毒的药物应选杀菌谱广、刺激性小的药物。喷雾用药物的浓度必须按照药物说明，不可任意加大或降低。喷雾药物用量可按每立方米空间5～25毫升计算。因每进行喷雾一次，可降低舍温2～4℃。所以在冬季、夏季不同季节，是否需要兼作降温等到不同目的，可灵活调节药液浓度或用量。畜禽带体消毒可根据情况，每3～5天1次或每天1～2次。最好使用电动机或机动喷雾器，手动喷雾器不易达到此要求。
5 正确选购消毒药物
在畜禽饲养过程中，评定消毒药的作用，较评定治疗药的疗效更为困难。但兽药市场上多种多样、不同名称的消毒药令人眼花缭乱，难以选择。现在数种甚至上千种商品名的消毒药，如按成份分类只有10多种，选购时应搞清是属哪一种类型，以便知道它的作用、特点以及是否适合你的需求。不要只凭广告宣传，如有的消毒药宣传对病毒的强毒株、超强毒株、变异株都有杀灭力，既可做平面消毒，又可做立体消毒等。所谓平面消毒是把消毒药喷在地面或墙壁上，立体消毒是喷在空中，所以实际上一样的，与消毒药的杀菌谱无关，只是一些玩弄文字游戏的宣传而已。选购消毒药时应选择有信誉的厂家和品牌，畜牧系统调拨的消毒药物质量是有保证的。不是盲目相信宣传或贪图价格低廉，购入浓度不够，质量不合格及过期消毒药物，影响消毒效果。
