菜篮子工程成立之初，就配套比较严格的制度，实行“菜篮子”市长负责制。近年更多通过市场和经济手段来调节稳定市场骨干企业，保证菜篮子产品的平稳供应。2012年中央财政安排“菜篮子”产品生产的资金超过166.8亿元，其中用在蛋奶肉等畜牧业项目上的补贴资金高达31亿元。
根据《广东省2012年扶持菜篮子产品生产项目(畜牧业)实施方案》，从事“菜篮子”产品(肉、菜、果、蛋、奶、水产品)的生产、加工、储备、流通的企业，保证广东省“菜篮子”产品供应，经营规模和指标达到规定标准，经过省“菜篮子”管理机构认定就可以成为广东省“菜篮子”基地。十二五期间广东省菜篮子办公室将认定并重点扶持300个。经认定和公示的的省“菜篮子”基地按规定享受有关扶持优惠政策，每个获得认定补助的生猪标准化养殖场还能获得奖励约50万元、肉牛标准化养殖场奖励约75万元、肉鸡、蛋鸡标准化养殖场奖励约30万元。
