1．消毒：采卵前，要对孵化工具进行消毒，如孵化盘、孵化用沙或海绵、孵化用水等，均用30％的高锰酸钾水溶液浸泡1小时，然后用清水冲洗干净，晾干备用。孵化用沙也可采用沸水消毒灭菌，晾干后备用。另外，对孵化温室要定期用紫外灯灭菌10～20分钟。
对刚采收的卵，在装盘前，用紫外灯照射3～5分钟，再用20％的高锰酸钾溶液浸浴2～5分钟，用干纱布擦干后再装盘。
2．装盘：用沙孵化鳖孵卵，装盘时先在孵化盘底层装2厘米厚、直径0.4厘米的粗沙，再铺一层粒径0.5～0.6毫米的细沙，3～5厘米厚，用板刮平，用一与卵径相近的圆形物体在沙上每隔1厘米钻一个孔，将卵轻轻放在孔上，最后用细沙将卵埋好，埋沙层厚度以0.5～1厘米最好。
用海绵作孵化介质，孵化盘内放与盘大小相等的海绵3块，每块厚1厘米，中间一块每隔2厘米打上一个直径1.2～1.4厘米的孔洞，底层海绵全泡在水中，中层打湿，放上鳖卵，上层海绵浸湿后拧干，作为覆盖保湿用。孵化时注意，下层海绵一定要泡在水中，水分不足时要加水，上层海绵既要湿润又要透气，所以不要含水分太多，每天喷水时只喷上层即可，而中层海绵打孔不要打得太大，要以卵粒下面2/5在孔内为宜，不可使鳖卵接触到下层海绵。
无论哪一种孵化方法，装盘时鳖卵的排列方式对孵化率影响不大。过去，有一种说法是“只有动物极向上的方式孵化率才高”。现在通过许多人的试验证明，有进一步探讨的余地。
为了便于管理和使稚鳖出壳整齐，通常每个孵化盘中只能装同一天产出的卵，并建立记录档案，编号，贴上标签，然后整齐地码放在孵化架上。
