动物使用疫苗后，同一批疫苗可能在不同地区、不同个体内出现不同反应，表现出不同的症状。如减食、精神沉郁、体温升高或突然死亡等现象。产生这些现象的主要原因是：
隐性感染
（潜伏期）动物的年龄、体质、品系的不同导致病毒感染后表现的反应不同，潜伏期的长短也不同，因此隐性感染是一个较为复杂的问题，特别是受疫区威胁的动物，在用疫苗前由于检测水平不到位，难以判断是否潜伏感染，因此容易出现用苗后的反应现象。
过敏反应
过敏反应是药品或疫苗在临床使用时不可避免的一种现象。由于动物个体差异的原因，相同的药品或疫苗在不同的动物身上会表现出不同的难以预料的过敏反应。临床上常见过敏反应以个体为主，但也有成窝出现过敏反应的情况发生，对于此种情况只能以抢救为主，一旦出现立即使用相应的抗过敏药物，另外接种疫苗后要认真观察，不要盲目离开。
免疫途径和免疫对象错误
免疫途径是根据不同疫苗毒株安全性，作用靶细胞情况而确定的，应根据说明书要求进行注射、滴鼻、点眼、口服或者刺种等，并保证接种时机体的健康状况良好。
多种疫苗同时使用
在使用疫苗时大家习惯于多种疫苗同时使用，特别是在使用活疫苗的过程中，多种疫苗同时刺激机体产生抗体之前，容易引发动物产生临床反应，因此在使用疫苗时不同疫苗的接种时间应尽量间隔3天以上，如果允许尽可能不使用联苗。
动物本身及外界环境的影响
生产高峰期及严重寄生虫感染的老、弱、病动物在使用疫苗时容易产生临床反应。另外外界环境变化、气温过冷过热、长途运输等应激因素都容易引起临床反应，在使用疫苗时应避开上述情况。
