药物残留是猪肉安全最大的隐患之一。据研究发现，某些兽用化学类药物、饲料添加剂的使用可能对人体产生致癌、致畸和致突变作用。饲料中添加米他布尔，能导致多数新生子猪先天性畸形；药物残留也可能导致病原菌产生耐药性，经常食用低剂量药物残留的食品可使细菌产生耐药性；药物残留还可能破坏人体肠道的菌群平衡。
有些专家认为，保障肉类安全的最根本方法是依靠科技，研制“绿色饲料”和“新型兽药”。就是通常所说的绿色饲料添加剂，如益生素、抗菌肽、酶制剂等。
益生素是相对于抗生素而言的，它是一种含有大量有益菌及其代谢产物和生长促进因子，具有维持肠道微生物平衡，提高机体健康水平的活菌制剂。益生素是良好的免疫激活剂，直接饲喂动物可有效地提高巨嗜细胞的活性，增强机体的免疫功能。益生素的有益菌群能在消化道内繁殖，促进消化道内多种氨基酸、维生素等一系列营养成分的有效合成和吸收利用，降低肠道pH值，抑制病原菌的繁殖，可通过改变肠道内的活菌数量和代谢，促进畜禽生长发育。
抗菌肽原指昆虫体内经诱导而产生的具有抗菌活性的碱性多肽物质。迄今为止，在不同动物组织中已发现了很多具有抗菌作用的蛋白质和多肽，已有70多种抗菌多肽的结构被测定，抗菌肽的概念得到了极大的扩展。抗菌肽具有广谱抗菌活性，对细菌有很强的杀伤作用，尤其是其对某些耐药性病原菌的杀灭作用更引起了人们的重视。但抗菌肽在动物体内含量极微。从动物体内提取抗菌肽产量低、费时长、工艺复杂、费用昂贵，无法实现犬规模生产，这成为制约抗菌肽进入实际应用的最大障碍。
新型兽药是指功效上可以替代传统兽药，并且对人和动物健康安全、无污染、无残留的绿色环保药物。中国科学院微生物研究所研发了高活性猪基因工程干扰素注射液，这是目前研发技术和生产工艺均已成熟的一种高活性广谱抗病毒蛋白类新型动物保健药物。主要适用范围：提高动物机体免疫系统的功能，增强动物的防病抗病能力；对于猪病毒性流行性腹泻、猪流感、水疱病、猪轮状病毒感染、猪传染性胃肠炎、经典蓝耳病等病毒感染都具有一定的预防效果，同时可减少由于换料、转群引起的应激反应，提高机体免疫力。
基因工程干扰素作用于细胞内的干扰素受体，经信号传导等一系列生物化学过程，启动基因合成抗病毒蛋白，抑制病毒多肽链的合成，阻断了病毒的繁殖，使病毒不能在机体内生长与繁殖，从而起到抗病毒的作用。
基因工程干扰素类蛋白药物有五大优点：1.干扰素具有广谱抗病毒、抗肿瘤、提高机体主动免疫力等生物学活性。2.是目前所知机体发挥抗病毒作用最快的防御体系，在短时间内就能使机体处于抗病毒状态，使机体在1周～3周内对病毒重复感染具有抗御作用。3.更广谱的抗病毒作用，对DNA和RNA病毒都有很好的杀伤效果，此外还具有增强机体免疫等良好的生物活性。4.可与灭活疫苗、抗体类药物联用，能起到弥补免疫空白期，缓解疫苗应激反应，增强免疫效果的作用。5.无药残、无副作用，不产生耐药性，可反复使用，是新型的“绿色兽药”。
