近年来，阿合奇县积极在本地柯尔克孜羊品质改良工作上下功夫，通过组建核心群养殖基地、对种公畜补贴、羊人工受精等方式，有效提高了本地羊品质，取得了良好经济效益，推动了阿合奇县畜牧业健康有序发展。
一是组建核心群，促进柯尔克孜羊的品种改良。自2013年组建柯尔克孜羊核心群以来，阿合奇县已建立核心群25个，其中2013年建立11个，2014 年建立13个，2015年建立1个，由政府出资筹建21个，个人自筹建设4个。目前，核心群共有基础母羊3750只，种公羊175只，经鉴定，核心群内所 产羔羊出生重平均提高0.4公斤，种公畜平均体重提高2.6公斤。
二是对种公畜进行补贴，推动种公羊推广使用。阿合奇县通过对 种公畜进行补贴的方式鼓励养殖户进行柯尔克孜羊品种改良，按照国家活畜良种补贴政策，每交易一只带有自治区良补耳标的种公畜羊可获国家补贴800元。 2010年至今，共有6950只柯尔克孜种公羊享受了种公畜补贴，有力促进了优良种公畜的推广使用。
三是加强柯尔克孜羊人工授精推动羊品质改良。近三年来，阿合奇县共投入资金15万元，完成人工授精柯尔克孜羊5640只，通过人工授精所产羔羊，平均出生体重增加0.7公斤，成年体重增加2.8公斤。
