1.选好种苗 减少温室蔬菜发生病虫草害的数量和机会，从而少用农药，减轻污染；首先，要选用经过严格检疫的种苗，防止危害性病虫草害的传播蔓延。其次，多选用抗病品种和抗虫品种。再次，种子在育苗前要进行温汤浸种，防止病虫害通过种子传入温室。
2.土壤处理采用高温闷棚方式进行棚室土壤高温消毒：每年8月，温室闲置的时候，每667平方米的温室可施入碎稻草1500公斤，钙30～60公斤（土壤PH〈6.5 时）或硫酸铵30～60公斤（PH≥6.5时），然后将土壤深翻，再整成宽60～70厘米，高30厘米的土方。废弃的棚膜盖在土方上，并在土方之间的沟内灌水，直到浸透土方为止，密封温室大棚7天以上，可有效杀灭土壤中的各种病虫害。
3.苗后防治（1）物理防治技术如棚菜电子病虫害防治仪，仪器采用微波与臭氧相结合的杀虫方式，可快速杀灭蔬菜上的病毒、细菌、真菌、害虫，效果十分显著。（2）使用生物农药Bt乳剂防治鳞翅目害虫幼虫；阿维菌素类农药防治害螨、斑潜蝇、小菜蛾、菜青虫等；释放丽蚜小蜂防治温室白粉虱；释放七星瓢虫防治蚜虫等。 （3）使用天然农药 ①辣椒（越辣越好）0.5公斤，加水50公斤煮15分钟后，去渣，向提取液中加0.1公斤普通洗衣粉，对水50公斤搅匀即可，豆类和瓜类上慎用。 ②将鲜丝瓜加少量水捣烂后，去渣留液，将母液以7∶23的比例加水，再放入少量肥皂液，搅匀后喷雾，瓜类、豆类慎用。 ③其他防治方法如生态防治、农业防治等。
