一是错过接种期。其原因多为原料准备跟不上，或灭菌灶没衔接好。由于接种时间延误，气温逐渐下降，菌丝发育缓慢，生理不能成熟，无法转入生殖生长。到了菌袋生理成熟时，气温升高，温度已不适应，造成整批菌袋不出菇，即使出菇也是菇体偏薄、品质较差。
二是配方不科学。白灵菇菌丝生长需要高氮营养物质，故发菌培养菌龄超过百日，如果养分积蓄不能满足营养生长时，就难出菇。基质中氮的浓度过高时，菌丝生长过旺，拖长营养生长时间，反而抑制原基形成。当菌丝进入生殖生长时，已错过自然低温刺激的良机，也不出菇。
三是养菌管理欠妥。接种后的菌袋在室内摆叠过密，菌袋间不透气，或在发菌期翻堆不及时，使菌丝严重缺氧；菌袋堆集过密，加之接种处于秋季，常出现秋热，导致菌温、袋温、室温聚增，造成底层菌袋“烧菌”，影响出菇。翻堆次数太少，上中下各层菌袋受光触氧不匀，生理成熟度有差异，造成出菇不一致。
四是、后熟培养未达标。有的栽培者认为白灵菇属侧耳科，与平菇近缘种，仿效平菇栽培技术，因此菌丝长满袋后就开口喷水，结果久不出菇；有的后熟期室内湿度太低，后熟时间延长，导致出菇期推迟；也有的因室内光照直射菌袋，造成菌袋内水分蒸发，菌丝体增厚，养分消耗，影响后熟。
五是催蕾控温失误。菌袋生理成熟后，还需要0～13℃的低温和变温刺激，逼原基形成，分化菇蕾。有的菌袋成熟后，没及时进棚码垛，留在室内恒温培养，延误了出菇期；也有的在菌袋进棚码垛后，自然气温已达到0℃，虽能满足低温刺激，但为了创造温差条件有的采取无限时蒸气加温，使垛内菌温聚集不散而烧菌，结果成批不长菇。
