一、根系吸收能力减弱，营养失调
萎蔫的叶片自上而下、从外向内发展，叶片不褪绿，根部和剖茎无病变症状。这种情况主要是由于较长时间干旱、土壤缺水或者土壤湿度大、板结缺氧，致使棉花根系发育不良，吸收养分受阻，造成营养失调；如果再突降大雨或遭遇连阴雨，发生更为严重。一般来讲，沙质土壤、土壤瘠薄、盐碱地、底肥不足以及缺少钾肥的棉田，相对发生较重。需要特别注意的是，发生这种情况的棉田，极易在中后期发生早衰，造成较大的损失。在中后期发生，典型症状可表现为以下几种：①叶柄基部变软，失水干缩。②叶片边缘呈现黄色，叶肉组织褪绿，但叶脉仍保持绿色；以后叶色由黄色变成紫红色、叶片皱缩、变脆。③叶片枯落时，茎秆顶端呈干焦状，蕾铃大量脱落。④根系发育不良，主根短而细，常成“鸡爪根”，支根、须根数量显著减少，颜色深褐色，尖端变褐腐烂。
建议应对措施：如土壤干旱应及时浇水，如土壤湿度大应及时中耕散湿。底肥施用不足，尤其对施用的底肥质量有怀疑的和钾肥使用量偏少的棉田，应尽早追施钾、磷肥，补充营养。在采取上述措施的同时，可选用磷酸二氢钾、精品二氢钾、六合一增产素、棉花抗病高产素、高硼高钾、磷酸二铵水溶液等对棉株叶面喷施，以快速缓解症状。
二、棉花黑根腐病
该病发生后，首先棉花叶片供水不足，白天叶片萎蔫，早晚可恢复，相继整株棉花萎蔫，叶片青枯。将病株拔下，可见主根木质层呈现浅褐色，其断面呈现深褐色病变（但剖茎未发现病变）。而因营养失调、干旱缺水所造成的打蔫，根系为正常的嫩色。苗期发生枯萎病的黑根腐病发生较重，反之则没有或者发生很轻。
其与前述营养失调的典型区别是：①棉苗稍矮化或矮化不明显，叶片皱缩或萎蔫，严重时发生青枯。②病苗茎基和根部紫黑色，逐渐腐烂，干燥后皮层干腐呈棕褐色，病部表皮纵裂，易脱落。湿度大时，病部产生灰白色霉层，是病原菌丝和内分生孢子。③病根比健根细，侧根增多。④根尖皮下组织发黑、变脆，后期根基部畸变肿大。⑤病株结铃明显减少。⑥棉花吐絮期为发病高峰，叶片萎蔫下垂，迅速青枯，但叶片并不立即脱落。
病原菌属半知菌拟黑根霉属根串珠霉菌，该菌寄主范围很广，可侵染豆科、茄科、葫芦科、锦葵科多种植物。病菌孢子能在土壤中存活多年，并能在病残体上越冬进行再侵染。病害发生与温度关系密切。土壤温度15～20℃时有利于病原侵入和病害发展，低于15℃、高于27℃发病很少，温度在30℃以上很难发病。棉田多年连作、土壤黏重、微酸性至碱性、腐殖质含量高、地势低洼、大水漫灌、土壤长期潮湿等条件下，利于发病。
建议应对措施：发病后可选用50％多菌灵600倍液、六高牌乙蒜素1000倍液、一支灵3000倍液、70％敌磺钠500倍液、70％恶霉灵800倍液，同时选择加配芸薹素内酯、DA－6、农喜十效素、复硝酚钠、细胞分裂素等调节剂或者前述的叶面肥混合喷雾，一般连喷2次即可。喷药的同时，对重病株可用药液喷施于棉株根部，效果突出。
