微生物棉饼脱毒剂是2001年2月获得国家发明专利的一种高科技的饲料发酵剂，又称纤维素酶制剂。它具有非常高的利用价值，一方面可将它用于棉饼脱毒发酵制成无毒棉饼饲料；另一方面可在秸秆饲料发酵中广泛应用，它能快速将秸秆中的纤维素、半纤维素分解转化成有价值的菌体蛋白，从而大幅度提高饲料的粗蛋白含量，是秸秆饲料生产技术上的根本性突破。下面介绍其三种用法：
一、制作无毒棉饼高蛋白饲料棉饼中富含植物性蛋白，是禽畜食用的好饲料，但因棉饼中含有毒性物质——棉酚，而棉酚的去除又非常困难，因此大量棉饼没有用在饲料上，造成很大的浪费。用棉饼脱毒剂可以轻易地解决这个难题。其操作是：按棉饼重的50％加清水拌湿，再加入少量的玉米面、麦麸作为发酵助剂，再按饼重的0．1％加入微生物棉饼脱毒剂，四者充分拌匀后放入盆、缸或在水泥地上堆积发酵脱毒，经3－5天后，棉饼上长出少许灰白色菌丝，并发出甜、香、酸、酒味，此时棉饼脱毒结束，一种良好的无毒棉饼饲料就制成了。
二、制作高蛋白青贮饲料在农作物秸秆收获时，将秸秆铡碎，按秸秆重量的0．05％加入棉饼脱毒剂，放入青贮器内（如水泥池、土窖或塑料袋等）进行发酵，和传统青贮一样，层层压实，最后封严，经3周左右，青贮饲料具有甜、香、酸、酒味时即可饲喂家畜。因脱毒剂具有防腐功能，青贮饲料可贮存3－5年（最好一年喂完）。以玉米秸秆为例，青贮前含粗纤维29．3％，粗蛋白为5．7％，青贮后粗纤维降为28．4％，粗蛋白上升为12．9％。
三、制作干秸秆高蛋白发酵饲料将干秸秆铡碎，放入清水中漂洗干净，捞出后在水泥地上沥去多余的水分（约1－2小时），水泥地进行消毒后，把秸秆铺成长方形的堆，每层厚15厘米左右，在堆料上撒一层发酵剂，并依前法一层秸秆一层发酵剂，其分三层，总计厚度45厘米，堆料结束后，盖上纤维袋保温，经3－5天发酵（冬春需4－5天），料面上长出灰白色菌丝，料发出甜、香、酸、酒味时即可饲喂牛、羊等。发酵料需经2天喂完，不宜久贮，以免变质。
