新发生的禽病种类多，防治工作量不断增大，随着养禽业的不断发展，以及商品贸易的增加，集约化饲养管理经验缺乏，防疫卫生技术跟不上等原因，致使新的禽病不断出现，诸如鸡传染性贫血、禽传染性支气管炎、鸡传染性法氏囊病、鸡产蛋下降综合征、鸡病毒性关节炎、禽流感、包涵体肝炎、雏鸭病毒性肝炎、肾型传染性支气管炎、J型淋巴白血病、番鸭细小病毒病、鸭疫里氏杆菌病、肉鸡腹水综合征和隐孢子虫病等。据有关资料不完全统计，对我国养禽业构成威胁和造成危害的疾病已达80多种，涉及传染病、寄生虫病、营养代谢病和中毒性疾病。其中以传染病最多，约占疾病总数的75%以上，所造成的损失也最大。细菌性疾病呈上升的趋势。不但禽病种类增加，发病禽的种类也在逐渐增多。因而我国禽病防治任务也越来越重，工作量也越来越大。就目前我国禽病防治技术力量而言，尚远远不能满足我国养禽业发展的需要。
部分病原出现新的变化，疫病的发生呈非典型化。在疫病的流行过程中，由于多种因素的影响，病原的毒力常发生变化，出现亚型株且变异速度明显变快。由于病原的抗原性、致病性及组织嗜性的变异，加上禽群中免疫水平不高或不一致，致使某些禽病在流行病学、症状和病理变化等方面出现非典型化变化，发生非典型化感染或发病，出现新的特征，导致临诊症状变得更加复杂，准确诊断难度加大。如非典型新城疫（产蛋下降和慢性死亡较多，其他症状不明显）就是最明显的例证。传染性法氏囊病毒和马立克氏病病毒都出现了超强毒株的报道。对于控制超强毒株，除提高改进疫苗质量外，还应着重考虑减少病毒造成的环境污染，加强卫生消毒等措施。抗原结构的变异和血清型多变，使得传统病原血清型及耐药菌株日益增多，使一些疫苗的预防控制越来越困难。鸡传染性支气管炎，以前在我国流行的主要是呼吸型，二十世纪90年代出现了嗜肾脏型，近年来又出现了腺胃型，使得疫苗的研究变得越来越困难。如果使用的疫苗与流行株血清型不符，常导致免疫失败。如鸡马立克氏病，在二十世纪70年代，野外毒株主要是一些强毒，到80年代，一些国家出现了超强毒，而90年代，在美国和欧洲又出现了超强毒株，每一次流行性毒株毒力的增强，都导致现有疫苗的免疫失败。可见，未来家禽传染病无论在流行上还是致病机理上都会越来越复杂，这对我们兽医工作者的要求也越来越高。
环境污染严重，增加了疫病传播机会。我国养禽业环境污染相当严重，制度不健全，隔离不严，养殖条件简陋，饲养密度过大，环境消毒不彻底等都是直接原因。另外，病死家禽处理不当，乱扔病死家禽，使病原到处扩散，也是造成环境污染的直接原因。更有甚者，一些不法商人为谋取暴利，收购倒买倒卖病死禽肉，不仅加剧了环境污染，而且严重危害了消费者的身体健康。由于环境污染，增加了疫病的传播机会和耐药菌株的产生，阻碍了我国养禽业的发展。
混合感染不断出现，多病联发或并发增多，增大了防治难度。在生产实际中，随疫病的增多，养殖密度的加大，加上环境消毒不严，预防措施不力等原因，两种或两种以上的病原同时感染，继发感染或病原的混合感染，在许多养殖场变得很普遍。目前，生产中发生的禽病，有多种病毒病同时感染的，如新城疫和传染性支气管炎；有多种细菌病同时发生的，如大肠杆菌和支原体病；有病毒和细菌混合感染的，如传染性支气管炎和大肠杆菌病；有病毒和寄生虫同时发生的，如新城疫和球虫病；有细菌和寄生虫同时发生的，如大肠杆菌病和球虫病；有遗传因素和饲养管理造成的，如呼吸系统疾病。另外，一些不同的病原还可以引起相同症状的疾病，如新城疫、传染性支气管炎、传染性喉气管炎、禽流感、鸡毒支原体感染、传染性鼻气管炎、大肠杆菌病、禽痘、肿头综合征、马立克氏病、禽霍乱、鼻气管鸟杆菌病、曲霉菌病、开口病、气囊螨虫病、氨中毒、福尔马林中毒、维生素A缺乏、腹水症等都可以引起呼吸道症状。这些病原的混合感染十分多见，而单一接种某种疫苗免疫效果也不是很理想。马立克氏病、传染性法氏囊病、白血病以及网状内皮组织增生症等还可引起免疫抑制。
