养猪业有污染问题，农委会依养猪场规模大小，逐步推展沼气发电，预计费时3年，看好全国半数的猪都能转型为绿能猪。
养猪场的污水及排泄物会留在猪舍，成为污染问题。使得农委会主委曹启鸿一心想推动养猪户发展太阳能及沼气发电，成为「六星级產业」。
农委会规划提供1.04%低利贷款，帮助猪农改善猪舍环境与设备;并要向行政院争取沼气发电趸售电价，每度由新台币3.9元调高为5元。
以全国约550万头猪来看，曹启鸿评估1500头以上规模的养猪场可做发展沼气发电，预计今年底达成30万头猪只转作绿能猪。
若行政院支持沼气发电趸售电价每度调高为5元，估明(2017)年7月将有60万头猪转型为绿能猪。并估约花3年，让全国约占半数的猪都转型为绿能猪。
政府的规划究竟「真的在动了吗?」完成屏东县内规模2万头以上的中央畜牧场及台糖畜殖场，转型做沼气发电的祥瑞能源科技股份有限公司总经理曾昱森就说，持续推案中，花3年让半数国產猪变绿能猪是可行。
他举例，目前已标到案，位在屏东县的台糖的新厝畜种场及泗林繁殖场，也都是规模2万头以上的场，就要动工转型做沼气发电了。逾1万头以上都为大场。
5000到1万头的中型场也有案件正在推动。他说，卜蜂的台南场就是5000头的场，已在动工中;另外大成有5000头与1万头，合计2场，正规划施工中。
5000头以下的小型场，他手上则有卜蜂在云林麦寮、南投水里的3000头规模2场，今年将施工。
曾昱森说明，1万头以上，在国内归为大型养猪场，仍以每度电可售3.9元保守计算，投资传统型发电约需投资400万元、高级型发电则约1500万元，都是约4.5年可回本。
中型场则要试做完成后，他较能推算投资金额与回本时间。小型场目前确认约需6到7年回本。
他建议，至少要1000头以上，较适合做沼气发电，转型为绿能猪。他还说，像他一样的业者，全国约计7、8家，又当全国养猪场能做沼气发电的都转型完成，后续还能做肥料生產，產业可持续推进。
