目前，在农药应用方面有以下几个问题：
施药机械不适应要求，农药利用率低。
当前，农村大量使用的是小型手动喷雾器及背负式机动弥雾器等小型药械，还是以“人背机器”为主，效率低并存在“跑冒滴漏”问题。同时基本上是“一个喷头打遍天下”，缺少良好的喷头特别是防飘失喷头。另外，农民习惯于大雾滴、大容量喷洒，浪费严重，农药有效利用率低。通常说打到靶标作物上的农药利用率大体上为35%左右，其他大部分农药都流失到非靶标作物、土壤或水域中。
一家一户分散防治，组织化程度低。
农民种田规模小，大多是一家一户分散防治病虫，组织化程度低，防治规模小，防治效率低，药害事故频发，损失比较大。
农民打药未经培训，不当用药比较突出。
农民田间施药大多数未经培训，“农村空心化、农业兼业化、农民老龄化”导致农民知识水平和科技素质下降，加之病虫防治技术性强，农药品种多，使农民难以掌握技术要领，不规范用药、过量用药、盲目用药情况比较普遍。
销售渠道乱，缺乏经营主体。
植保部门原来参与农药经营，现在已退出不再参与“开方卖药”，一大批个体户从事农药经营，他们大多不熟悉植保及农药应用，经销商小、散、乱，缺乏主体。
法规建设滞后，监管不到位。
在植保方面，我们目前仅有《农药管理条例》及《植物检疫条例》，法律支持不够，法规建设滞后，而且监管与处罚力度也不够。对假冒伪劣产品及乱添加隐性成分等问题，处罚没有起到震慑作用，守法成本高于违法成本。
技术研究跟不上，支持力度较弱。
在施药技术及农药利用率方面，研发力量不足，研究项目、经费支持力度不够，且力量分散，技术研发、组装集成不能满足要求。
