工商部门还积极扶持农民专业合作社的发展，合作社促使农业由千家万户的单干式向资源优化整合的产业化转变。在各地“合作社 农户 订单”的模式中，工商部门制定的订单合同条款与合作社自制的章程对签约农户形成了双重约束。
比如合作社对守信农户在年底根据经营情况发放奖金、返利，对不履约的农户取消下一年的签约资格甚至取消会员资格等。为提高农业订单的含金量和吸引力，近年来，浙江工商部门提出“品牌兴农”。
在安吉，工商部门帮助农民创造了用商标品牌带动一个产业的神话，自成功注册“安吉白茶”后，白茶产业短短几年内发展成为该县支柱产业。
在临海，工商部门围绕当地四大特色农产品品牌，创造出“品牌 合作社 订单 农户”的新型模式，有品牌的农产品价格要比普通农产品高出两倍以上，当地的“岩鱼头”蜜桔去年的最高售价甚至达到每千克50元，比普通蜜桔整整高出15倍。
为了实现订单农业的全程动态跟踪监管，浙江工商在经济户口的基础上，为农业订单建立了数据库，将所有订单数据输入电脑。这样每一份订单的签约主体、数量和履行情况都一目了然。在嘉善、海盐、文成等地，工商部门还开展了对订单农户的信用培育，以数据库为基础，进行“信用农户”和“信用村”的评选，并落实奖惩措施，积极营造“以守信履约为荣、以背信毁约为耻”的氛围。
