一般养殖虾池通常需要施肥“养水”，即培育基础饵料和保持良好的水色。在养殖过程中，饵料的投放、残饵的分解、对虾排泄物的产生和分解等，都会使养殖水富含各种营养物质以及有机与无机碎屑。当虾池排放的污水物质总量超出该区域环境容量的时候，也可能造成该区域的水质污染和富营养化。
　
　  消毒剂、抗菌素对生态的影响
　
  　虾池消毒和病害防治，是对虾养殖过程中必不可少的重要环节。对虾病害防治药物通常以抗菌素为主，富含消毒剂和抗菌素的虾池水大量排放后，对近岸水域微生物生态系统产生了直接的影响。各类污染物质进入近岸水域生态环境后，其最终的降解和净化都与微生物的活动有关。当正常的微生物生态系统受到干扰或破坏之后，污染物质的分解速率易受到影响，自净能力明显降低，这样将会导致水质的进一步恶化。
　
　  虾池废水排放造成自身污染
　
　  虾池养殖水大量排放污染到近岸水域的同时，也造成了自身污染，危及对虾养殖业的本身。虾池排放水造成近岸水域污染后，海水中的氨氮和硫化物等有害物质含量升高。当这种受污染的海水再抽（放）进虾池后，轻者影响对虾生长，重则很可能发生病害。特别是污染导致赤潮发生时，易造成生物大量死亡，其尸体在分解过程中导致水质严重恶化，会使赤潮发生区域的养殖对象造成大量死亡。其自身污染不仅影响近岸生态环境，而且危害到对虾养殖业的本身。
　
　  增强海洋环境保护意识，克服重陆轻海造成海域污染的思想，是治理海洋环境污染的关键所在；控制陆源污染是治理海洋污染的重要环节。认识不到位、陆污不根治，海洋环境污染就不可避免。在不少渔农的心目中，大海仍然是一个天然的大垃圾场，工业、生活及池塘养殖废水可以任意排放。应当通过多种形式的宣传教育，使环境保护这一基本国策更加深入人心，使广大渔农能够深刻地认识到，近海海域环境与他们的生存、事业和发展密切相关，在此笔者谈点个人看法。
　
　  随着对虾种苗培育和养殖生产趋向工厂化、集约化，苗种生产和养殖生产单位对各种药品的依赖性日益提高。在药品生产、使用过程中，药品生产商为扩大销售，频频更换产品名称。育苗、养殖生产单位为保险起见，随意加大用药量。在水质改良剂、生物制剂生产中，缺乏严格的产品检测标准，产品无保质期、无主要成分证明等现象屡屡可见。因此，必须加强管理，科学用药，严格控制用药水的排放。如少数发生病害的虾池，在积极治疗期间，应当封闭池水，禁止排放水。对于病害暴发，造成对虾倾池死亡的，虾池水需经严格消毒、杀菌，并待消毒剂、杀菌剂充分氧化、失效后才能排水。为了最大限度地减少消毒剂、治病剂等药物对近岸水域生态的影响，科研、卫生防疫或环保部门应积极开发或推荐若干针对性强、存留期短的安全药物供选择使用。
　
　  当前海水养殖业中污染养殖水域的主要是对虾养殖业、港湾地区的鱼类养殖业和局部地区的贝类筏式养殖。为了降低养殖废水产生的污染，全面规范、合理布局是一个首要问题。如养殖虾池的数量要根据当地近岸海域的环境容量、滩涂与海上网箱养殖现状和发展趋势等进行科学地规划，使排放的虾池养殖水和其他污水的污染物总量，不超过近岸水域的自净能力。对已建成的大面积集约化对虾养殖区域，或者将部分虾池改造，养殖其他用水量小的种类，或者建立污水处理厂等，虾池排出的污水经过集中处理后才可排放。海水养殖应当科学制定养殖密度，并应当合理投饵、施肥，正确使用药物，防止造成海洋环境的污染。
　
　  优化养殖环境保护和改善虾池及周围邻近水域的生态环境非常关键。生产实践证明，不但要保护好虾池内部的生态环境和全面掌握虾池各期用水量、投喂饵料数量及残余量、有机物质含量、有毒有害物的含量，而且虾池外部水环境的保护同样是不容忽视。随着滩涂养殖业的发展，布局不合理，在同一区域内养殖池密集的现象很普遍。特别在海水循环能力差、滩涂水质交换缓慢海区，矛盾非常突出。
　
　  提高水产饲料效力，减少水环境污染。我国近岸海域的海水污染日益严重，其成因除了河流和城市生活污水入海，近年来海水养殖业的发展也不容忽视。以养殖为例，据了解，即使是管理最好的虾池也有３０％的饵料未被摄食，氮、磷营养物是对虾池及附近浅海的主要污染物。因此，如何提高水产饲料效力、减轻环境污染是水产养殖及水产饲料生产方面面临的一大任务。我们必须加大对水产动物营养参数、水产动物免疫力、抗病力与营养素关系的研究力度，开发出优质饲料、添加剂、诱食剂，开发低污染的新型环保饲料和与之相匹配的养殖工艺等，大力提高水产饲效力，努力减轻环境污染压力。
　
　  改变养殖方式，探讨生态养殖新途径。养殖模式的改变，不仅使养殖区的养殖负荷得以减轻，而且利用不同养殖生物在摄食习性、活动能力等方面的差异，可有效地促进虾池内有机物的循环，达到改变养殖环境，减少病害发生，增加养殖者收益的目的。对虾养殖方式的改进，还可以减少用水量，减轻污染。如少放苗、少投饵、少换水的生态养殖方式。还有虾鱼贝藻混养方式，即通过混套养一些刮食性鱼类和滤食性贝类，吸收虾池里的氨氮等有害物质，通过投放光合细菌，改善或净化虾池水质，减少换水量。同时通过优化养殖工艺以及合理的规划与科学的管理，使得新技术、新设备、新工艺为养殖对象提供优良的生存环境，从而使其获得更快、更好的生长速度和优良品质。推广和开展高效、环保的养殖运作方式，必将在最大程度上提高海水养殖业的经济效益和生态效益。