肉类产业中，牛羊肉是内蒙古自治区在农牧业结构战略性调整中肉类产业中的支柱产业，是增加农畜产品附加值和农牧民收入的主要途径。肉类产业在内蒙古自治区畜牧业乃至全区经济发展中占有重要的地位。目前，全区已有肉类加工企业800多家，其中以加工牛羊肉为主的肉类加工企业794家，大型肉类加工企业102 家，加工能力达108万吨，已形成了草原兴发、科尔沁牛业、塞飞亚、伊盛、沁绿、小肥羊和赤峰群鹏等龙头肉类加工企业，基本覆盖全区各盟市旗县，带动了地方经济的迅速发展，增加了农牧民的经济收入。

但是，现阶段内蒙古肉产业在技术创新方面还存在许多问题，一是缺乏专用的肉牛、肉羊品种，选育具有盲目性，自有的品种资源在快速地丧失，没有自己的品牌优势；二是生产具有盲目性，没有充分利用好杂种优势进行肉牛、肉羊的生产；三是肉类产业生产基地建设还很不规范，商品畜的出栏率比较低、个体生产性能差、规模小、总量少，还不能完全满足加工企业的需求；四是牛羊肉加工企业技术落后，深加工转化率不到3%；五是企业规模小、花色品种较少、优质高档名牌产品比重低、产品结构单一，主要以活畜交易和热鲜肉为主，缺乏市场竞争力和增值潜力，肉牛、肉羊生产与加工发展失衡，牛羊肉深加工严重滞后；六是缺乏牛羊肉分级标准和系统评定方法，没有形成产业化的肉牛、肉羊生产、加工、供应、销售渠道，造成自治区高档牛羊肉形不成区域化集中生产，使有限的高等级良种得不到最大限度的利用。

但是也要看到，内蒙古在肉产业研究与开发方面有着独特的优势，牛羊胚胎移植整体技术水平和移植数量居全国之首。内蒙古自治区胚胎移植高级技术专家占全国的 70%左右。内蒙古自治区家畜改良站是3个国家级胚胎移植中心之一，制定了国家胚胎移植技术标准。内蒙古大学哺乳动物生殖生物学及生物技术实验室为国家重点实验室。内蒙古农牧业科学院也是国内3个年胚胎移植数量最多的单位之一。内蒙古自治区大规模胚胎移植技术水平为全国领先。内蒙古大学哺乳动物生殖生物学及生物技术实验室为国家重点实验室，其学术带头人为中国工程院院士旭日干教授。在家畜胚胎移植、体外受精、性别控制、核移植与转基因动物技术的研究方面曾取得多项成果。特别是在家畜体外受精技术方面取得了重大突破，于1989年成功地培育出我国首胎、首批?试管绵羊?和?试管牛?，提出了牛羊卵母细胞体外成熟、体外受精、体外发育、冷冻保存和试管胚移植的一整套技术线路，使我国该领域的研究达到了世界先进水平，《牛体外受精技术的研究与开发》获国家科技进步二等奖。内蒙古自治区大规模胚胎移植技术水平为全国领先，牛冻胚移植成活率45%以上，鲜胚移植成活率60%左右，羊冻胚移植成活率60%左右，鲜胚移植成活率70%左右。

未来5年内，自治区科技管理部门和畜牧业管理部门将在肉产业技术创新方面做出重点突破，将努力建设1个肉业企业研发中心、2个不同类型草原区国家级肉业发展关键技术集成示范区。开展牛羊抗性及产肉性状基因的筛选和克隆及其品系培育、肉用型牛羊杂交组合配套技术研究与示范、肉羊良种快速繁育技术、万头肉牛肉羊绿色饲养关键技术、牛羊主要传染病综合防治技术等方面的研究与示范。为稳定年产300万吨优质安全肉类产品提供科技支撑。

主要创新工作内容包括：1.草原牛羊抗性及产肉性状基因的筛选和克隆及其品系培育。2.草原肉用型牛羊杂交组合配套技术研究与示范。3.草原肉羊良种快速繁育技术集成研究与产业化示范。4.万头草原肉牛肉羊绿色饲养关键技术的集成与示范。5.草原牛羊主要传染病综合防治技术研究与示范。6.草原绿色千吨牛羊肉制品生产关键技术研究及产业化示范。