瓜、茄类秧苗在白天需保持较高温度，才能满足秧苗对热量的要求。试验表明，冬季一般在长期低温下育的苗都为老化苗。但夜间必须控制相对较低的温度。苗床中秧苗徒长的直接原因就是因为夜温过高引起的。因此，在电热温床育苗时，温度管理至关重要。目前一般采取变温管理，根据不同的发育阶段，控制相应的温度。夜间比白天低5～10℃。
播种苗床，齐苗后按上表温度要求进行管理，寒流来临时要注意加温防冻。
移苗苗床，在移苗后7～10天，应以保温、防冻、促进缓苗为目的的温度管理，直至活棵。此时可密闭大、小棚，棚温保持30～35℃。如棚温超过35℃，可在中午前后将小棚或大棚进行短时间通风。移苗活棵后，应根据蔬菜种类、苗情进行相应的棚温管理。对喜温蔬菜或秧苗较小、苗距较大，并用于早熟栽培的，棚温可高些。一般白天气温维持25～28℃，夜间15～17℃。小棚迟揭早盖，夜间盖严草帘、遮阳网、无纺布等覆盖物。气温超过30℃，中午前后稍加通风。对耐寒蔬菜或苗距较小、幼苗较大、定植期较迟的，则棚温可稍低。一般白天气温维持20～22℃为宜，棚膜宜早揭晚盖；夜间10～12℃。定植前1个月左右，露地气温逐渐网升，棚内温度随之增高，幼苗生长速度加快，此时可进行适当的低温锻炼。棚内最低温度在5℃以上时，夜间在小棚上可不再覆盖草帘、遮阳网和无纺布等覆盖物。江浙一带在2月中旬至3月上旬揭除覆盖物。定植前7～10天，应进行低温锻炼，逐步增大大棚通风量，夜间逐步揭去草帘、小棚膜，大棚昼夜通风，但要逐步进行，寒流来时仍应注意保温。
长江流域冬季和早春育苗期间多阴天及雨雪天气，光照弱，温度低，若应用冷床育苗，苗床中平均气温大致为11～15℃，育苗中期甚至会降至8～10℃。因此，该地区必须利用设施育苗的优势，采取保温与加温并重的措施，创造符合秧苗生长发育需要的温度等环境条件，培育充分健壮的秧苗。
