①系统找不到硬盘
此类故障比较常见，即从硬盘无法启动，从A盘启动也无法进入C盘，使用CMOS中的自动jian测功能也无法发现硬盘的存在。这种故障大都出现在连接电缆或IDE口端口上，硬盘本身的故障率很少，可通过重新插拔硬盘电缆或者改换IDE口及电缆等进行替换试验，可很快发现故障的所在。如果新接上的硬盘不承认，还有一个常见的原因就是硬盘上的主从条线，如果硬盘接在IDE的主盘位置，则硬盘必须跳为主盘状，跳线错误一般无法检测到硬盘。
②CMOS引起的故障
CMOS的正确与否直接影响硬盘的正常使用，这里主要指其中的硬盘类型。好在现在的机器都支持"IDE auto detect"的功能，可自动检测硬盘的类型。当连接新的硬盘或者更换新的硬盘后都要通过此功能重新进行设置类型。当然，现在有的类型的主板可自动识别硬盘的类型。
当硬盘类型错误时，有时干脆无法启动系统，有时能够启动，但会发生读写错误。比如CMOS中的硬盘类型小于实际的硬盘容量，则硬盘后面的扇区将无法读写，如果是多分区状态则个别分区将丢失。还有一个重要的故障原因，由于目前的IDE都支持逻辑参数类型，硬盘可采用Normal、LBA、 Large等。
如果在一般的模式下安装了数据，而又在CMOS中改为其他的模式，则会发生硬盘的读写错误故障，因为其物理地质的映射关系已经改变，将无法读取原来的正确硬盘位置。
③主引导程序引起的启动故障
硬盘的主引导扇区是硬盘中的最为敏感的一个部件，其中的主引导程序是它的一部分，此段程序主要用于检测硬盘分区的正确性，并确定活动分区，负责把引导权移jiao给活动分区的DOS或其他操作系统。此段程序损坏将无法从硬盘引导，但从软区或光区之后可对硬盘进行读写。修复此故障的方法较为简单，使用高版本DOS的fdisk最为方便，当带参数/mbr运行时，将直接更换(重写)硬盘的主引导程序。实际上硬盘的主引导扇区正是此程序建立的，fdisk。exe之中包含有完整的硬盘主引导程序。
虽然DOS版本不断更新，但硬盘的主引导程序一直没有变化，从DOS 3。x到目前有winDOS 95的DOS，所以只要找到一种DOS引导盘启动系统并运行此程序即可修复。另外，像kv300等其他工具软件也具有此功能。
④分区表错误引导的启动故障
分区表错误是硬盘的严重错误，不同错误的程度会造成不同的损失。如果是没有活动分区标志，则计算机无法启动。但从软区或光区引导系统后可对硬盘读写，可通过fdisk重置活动分区进行修复。
如果是某一分区类型错误，可造成某一分区的丢失。分区表的第四个字节为分区类型值，正常的可引导的大于32mb的基本DOS分区值为06，而扩展的DOS分区值是05。如果把基本DOS分区类型改为05则无法启动系统，并且不能读写其中的数据。如果把06改为DOS不识别的类型如efh，则 DOS认为改分区不是DOS分区，当然无法读写。很多人利用此类型值实现单个分区的加密技术，恢复原来的正确类型值即可使该分区恢复正常。
分区表中还有其他数据用于纪录分区的起始或终止地址。这些数据的损坏将造成该分区的混乱或丢失，一般无法进行手工恢复，唯一的方法是用备份的分区表数据重新写回，或者从其他的相同类型的并且分区状况相同的硬盘上获取分区表数据，否则将导致其他的数据永久的丢失。
在对主引导扇区进行操作时，可采用nu等工具软件，操作非常的方便，可直接对硬盘主引导扇区进行读写或编辑。当然也可采用debug进行操作，但操作繁琐并且具有一定的风险。
⑤分区有效标志错误引起的硬盘故障
在硬盘主引导扇区中还存在一个重要的部分，那就是其最后的两个字节:55aah，此字为扇区的有效标志。当从硬盘，软盘或光区启动时，将检测这两个字节，如果存在则认为有硬盘存在，否则将不承认硬盘。此标志时从硬盘启动将转入rom basic或提示放入软盘。从软盘启动时无法转入硬盘。此处可用于整个硬盘的加密技术。可采用debug方法进行恢复处理。
另外，DOS引导扇区仍有这样的标志存在，当DOS引导扇区无引导标志时，系统启动将显示为:"missing operating system"。其修复的方法可采用的主引导扇区修复方法，只是地址不同，更方便的方法是使用下面的DOS系统通用的修复方法。
